Identification of direct residue contacts in protein–protein interaction by message passing

論文は、こちら：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2629192/

• 2つの変数x,y間に定義される量
• I(X;Y) = ΣΣ p(x,y) log p(x,y)/p(x)p(y)
• 独立性の判断に使用。決定係数R^2と同様0以上1以下の値をとる
• 決定係数は線形回帰およびパラメトリック手法
• この方法はノンパラメトリック
• direct/indirectの区別はこの量で区別する事は出来ない
• direct/indirectの区別をつける方法：偏相関係数の使用、最大エントロピー原理の利用(平均、分散等の代表値の情報からエントロピーを最大する分布を選択する方法)
• Q-state Potts model　←　統計物理学の知識が必要